بررسی فیلوژنی 6 گونه از کفال ماهیان ایران به روش مولکولی pcr- sequencing

پایان نامه
چکیده

در این مطالعه، جهت تعیین تفاوت های ژنتیکی و روابط خویشاوندی میان 6 گونه از خانواده کفال ماهیان (mugil cephalus, liza subviridis, valamugil buchanani liza saliens, liza aurata, mugil capito,) از روش مولکولیpcr-sequencing استفاده شد .گونه های liza saliens و liza aurata از دریای خزر و گونه های mugil cephalus, liza subviridis, valamugil buchanani از خلیج فارس و دریای عمان جمع آوری شدند. نمونه هایی از کفال وارداتی از مصر ((mugil capito از موسسه تحقیقات گمیشان گرگان نیز جمع آوری شدند (این نمونه ها به همراه گونه mugil cephalus از مصر وارد ایران شد). dna این نمونه ها به روش فنل- کلروفرم استخراج گردید. قعطعات ژنوم (16s rrna میتوکندریایی) طی فرآیندpcr تکثیر و سپس برای توالی یابی به شرکت تکاپوزیست و از آنجا به کشور فرانسه فرستاده شدند. آنالیز توالی ها نشان داد که بیشترین تفاوت ژنتیکی بینm. cephalus و 5 گونه دیگر مورد مطالعه مشاهده شد. درخت بدست آمده بروش neighbor-joining نشان داد که دو گونه l. saliens و l. aurata در یک شاخه و گونهl. subviridis در شاخه ای جدا قرار گرفتند درصورتیکه درخت رسم شده بروشmaximum parsimony نشان داد که گونه های l. subviridis و l. aurata در یک شاخه قرار می گیرند و گونه l. saliensدر شاخه ای جدا قرار گرفت. باتوجه به این نتایج, این سوال مطرح می شود که چرا گونه های مختلف این جنس در یک شاخه قرار نمی گیرند ؟

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

شناسایی مولکولی گونه های مالاسزیا به روش PCR-sequencing در نیروهای نظامی جزائر ابوموسی، تنب بزرگ و سیری، خلیج فارس، 91-1390

زمینه و هدف: آگاهی از بیماری های قارچی و تعیین هویت قارچ های عامل، در هر منطقه ضروری است، این مطالعه با هدف بررسی و شناسایی مولکولی گونه های مالاسزیای عامل تینه آ ورسیکالر و پیتیروسپوروزیس در نیروهای نظامی جزائر ابوموسی، تنب بزرگ و سیری صورت گرفت. روش‌ها: این مطالعه  به صورت مقطعی از مهر سال 1390 تا شهریور سال 1391 در سه جزیره ابوموسی، تنب بزرگ و سیری (خلیج فارس) بر افراد نظامی انجام شد، پس از ...

متن کامل

فیلوژنی مولکولی سه گونه دنبلان کوهی از ایران براساس ژنوم ریبوزومی

نمونه هایی از سه گونه دنبلان کوهی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران جمع آوری شد. منطقه its شامل ژنs 8/5 از rdna با استفاده از آغازگرهای عمومی its4 وits1  تکثیر و توالی یابی شد. توالی های به دست آمده با سایر آرایه های معتبرِ مستخرج از بانک ژن مقایسه شد. در میان 12 نمونه مطالعه شده، هفت جدایه با نمونه های terfezia claveryi گزارش شده توسط سایر محققان، مطابقت داشت. نمونه های t. claveryi ایرانی به طور م...

متن کامل

شیوع گونه های مالاسزیا در بیماران مبتلا به درماتیت سبورئیک به روش sequencing – pcr

زمینه و هدف: مالاسزیا مخمر چربی دوست است که جزء فلور نرمال پوست انسان و مهره داران خونگرم محسوب می شود. این قارچ به عنوان یکی از عوامل فرصت طلب بیماریزا در بیماری درماتیت سبورئیک است. روش های فنوتیپیک برای شناسائی گونه های جدید ناتوان است. در این تحقیق  مخمر های جدا شده از  نمونه های پوسته سر بیماران مبتلا به درماتیت سبورئیک مراجعه کننده به کلینیک های پوست شهرستان تنکابن با روشpcr-sequencing بر...

متن کامل

بررسی مولکولی گونه های بیماریزای آسپرژیلوس جدا شده زخم پای افراد دیابتی با استفاده از روش Nested PCR

Background and Aim:  PCR has high sensitivity and specificity for the determination offungal DNA. It is also useful for rapid identification of the most common species of Aspergillus. The purpose of this study was to compare culture method with nested PCR method to determine Aspergillesion in diabetic foot patient in Imam Khomeini Hospital, Tehran. Material and Methods: Sixty-five case...

متن کامل

تشخیص باسیلوس کواگولانس در محصولات پروبیوتیک به روش مولکولی PCR

مقدمه: پروبیوتیک‌ها میکروارگانیسم‌های زنده‌ای هستند که اگر در مقادیر کافی تجویز گردند اثرات مفید سلامتی بر روی میزبان خواهند داشت. باسیلوس کواگولانس یک باکتری پروبیوتیکی گرم مثبت، هوازی تا غیر هوازی اختیاری، کاتالاز مثبت، اکسیداز منفی و تولید کننده اندوسپور می باشد. هدف از این مطالعه شناسایی سریع مولکولی باسیلوس کواگولانس در محصولات پروبیوتیک است که طبق اطلاعا...

متن کامل

تشخیص مولکولی گونه های کاندیدا با استفاده از ژن کدکننده ۶۵ کیلودالتونی مانوپروتئین به روش pcr

سابقه و هدف: عفونت های قارچی مهاجم به عنوان یک مشکل اساسی در سلامت عمومی گزارش می شود به ویژه کاندیدیازیس سیستمیک که موجب افزایش مرگ و میر در افراد ایمنوکومپرامایز از قبیل بیماران ایدزی و نوتروپنیک تحت شیمی درمانییا پیوند مغز استخوان می شود. تشخیص اولیه کاندیدیازیس سیستمیک اغلب مشکل است در نتیجه درمان موثر اغلب با تاخیر شروع می شود. بنابراین استفاده از روش هایی جهت کاهش زمان تشخیص عفونت های قار...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری - دانشکده مرتع و آبخیزداری و شیلات و محیط زیست

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023